Comptage automatique de colonies dans des boites de Pétri.

Reactiv’IP a développé un script Python spécifique, basé sur la librairie IPSDK, pour le comptage et la mesure de colonies de bactéries dans des boites de Pétri.

Petri_EasyResult

Colonies de bactéries détectées, marquées par un code couleur,

Cette application permets de compter très rapidement le nombre de colonies présentes dans la boite de pétri. Pour cette image, 255 colonies ont été détectées. Les images sont acquises à l’aide d’un banc macro avec un éclairage annulaire.

Une fois la segmentation réalisée, il est aussi possible de réaliser automatiquement des mesures sur chaque objet.

Petri_EasyValues

Exemple plus complexe

L’utilisation de la librairie IPSDK rend possible l’adaptation du script pour analyser des images plus délicates. Par exemple, l’image droite présente une autre boite de Pétri avec un marquage rouge de très nombreuses colonies de petites tailles. Pour ce cas aussi, la détection est de très bonne qualité en comparaison avec un comptage manuel.